左相召集剧情介绍群党商议对付霍乱之危，将都城与城外隔离，并任命陈赫去活人署医治。
陈赫从英徽那得知，他的父亲洪参判病死于霍乱，全家人陷于绝望期间，英莱却坚持照顾到其临终，所以她对霍乱特别恐惧和害怕。英徽希望陈赫重新慎重考虑，陈赫仍决定冒着风险出城治病。
来到活人署的陈赫对眼前的景象惊呆，医员丢下病人忙着逃跑，大量的霍乱患者苦不堪言，无人救治。陈赫与忙着为村民贴护身符的许医员发生争执，但无奈说服不了他们的传统观念。许医员也得了霍乱，被同僚丢弃，陈赫带着他去给植儿母亲看病。
景卓向左相提出了有人借机哄抬物价的事实，希望严查，左相长子金大钧对此驳斥，左相决定先以隔离疫情，防止扩散为主。李昰应带着得了霍乱的爱子到左相处恳请刘御医救治，遭到了驱赶。他想起春红对陈赫医术的称赞，遂出城寻找。
英莱出去打听城外的情况，遇到暴民，就在危机之时被景卓救下。关心英莱的景卓展现了体贴的一面。
仅以调制的盐水、糖水勉强缓解患者症状的陈赫，面对疫情感到绝望。植儿的父亲和赶来的李昰应主动提出帮忙。李昰应顺藤摸瓜，从周八那里找到了趁着霍乱之危，囤货居奇的幕后主使，竟是左相长子。在春红的帮助下，智取到500两。得知情况的英莱也赶去支援陈赫，并与他互相鼓励。
打算带英莱离开疫区的景卓，遭到了拒绝，不惜拔剑与陈赫相对!
越空仁医第5集剧情介绍植儿的父亲打造出简易版点滴用器具，陈赫给英莱示范如何静脉注射。面对执意要带走英莱的景卓，陈赫坦诚是自己要求她前来帮忙。李昰应怒斥景卓一番。命福因霍乱加重病危，陈赫知道他就是日后继位的高宗，命不该绝，采用了大腿的静脉注射后，身体康复。
英徽和其成员偷偷送来大量援助物资，众人欣喜，看到战胜霍乱的曙光。因为连续过度劳累，陈赫感染上霍乱!左相得知英莱在疫区帮忙，感到不满。英莱按照陈赫的医嘱，为他静脉注射。倍感失落的景卓借酒消愁，找英徽谈论起儿时相处的种种，作为庶出，从小就只能低头做人，深感压抑。
得知陈赫病情的春红前来探望，打算给他换一个更好的环境去治疗，遭到了英莱的拒绝和阻止。陈赫病危，英莱对他大腿静脉注射。昏迷中的陈赫听到呼唤醒来，度过霍乱之危。
刘御医向左相提议，烧毁土幕村，以绝后患。景卓激烈反驳未果，为保护英莱，只得请命前往。英莱对此行径感到痛恨，与景卓的隔阂进一步加深。植儿的母亲在大火中为保护植儿离开人世，众人伤痛之余，陈赫发觉自己并不能改变历史原有的轨迹。
越空仁医第6集剧情介绍霍乱结束后，陈赫继续留在活人署工作，给医员讲解医学知识。来此探望的英莱向陈赫打听美娜的事情。
以无名客身份劫盗的英徽，将大量赃物与周八销赃交易，被偷偷跟踪而来的李昰应发现。英徽虽放走了李昰应，但以其性命威胁他禁言。
春红邀请活人署一行人前来并热情招待，她请求陈赫为自家的一名妓生桂香看病。陈赫诊断桂香患梅毒，并向春红和李昰应解释了病发的原因。因为当时没有青霉素，所以陈赫判定此病无救。李昰应回想起当年他因帮助桂香摆脱金大钧非礼，而与她熟识。
陈赫在活人署与许医员谈论当时的治疗手段，决定在去妓坊查看病情，英莱执意要同去，陈赫只得答应。妓生因为害怕外界流言，纷纷拒绝检查。英莱按照陈赫先前的指点，为春红做了身体检查。刘御医劝桂香喝下水银解脱，被陈赫阻止。
景卓向陈赫郑重交涉，禁止他再带英莱外出行医。陈赫回想起手工提取盘尼西林的事情，尝试绘制草图。
桂香被李昰应的肺腑之言所感，说出了自己患梅毒的原因。怒不可遏的李昰应查出了害桂香得梅毒的洋人，与金大钧有关。陈赫意识到如果此时发明了盘尼西林，将改变历史正常的行进，决意放弃研制。
为绝后患，与金大钧串通的刘御医欲将桂香带走，岂料李昰应已先前一步把桂香转移，并要求陈赫照顾。
