木增晚到一步，吴郎中已经被阿照劝走，吴郎中离开前阿照还跟吴郎中要了一份打胎药。吴郎中离开之前，被西和阻拦，阿虎把吴郎中抓到大殿，通过吴郎中的嘴，木增得知所有真相，当知道阿照拿了打胎药之后，木增终于大怒。
而此时的阿照已经把打胎药倒入茶水，来到阿勒邱面前，表示认错，给阿勒邱喝下打胎药。木增赶到，将阿照打入大牢，决定当晚问斩。而阿勒邱肚子里的孩子却阴差阳错的保住了。
眼看要死，阿照依旧平静，阿勒邱亲自见她，和她一番交心，之后阿勒邱居然拉着阿照要把她救走，甚至在阿勒邱自己命悬一线的时候还想着阿照安危，阿勒邱的姐妹之情终于感动阿照，阿照大彻大悟，回到庵堂，忏悔自己的一生。
而此时的阿虎，已经在西和的指使下，偷偷进入木府重地，破坏了古籍大藏经，并且在没被人发现之前，逃离丽江，大藏经一毁，文化融合的希望就此断绝，难道在西和的阴谋下，木府最终的结局还是一场大战么?
木府风云分集剧情介绍第40集（大结局）阿虎毁了大藏经之后，跟西和回到永宁，在西和的指使下，用弩箭刺杀了木坤，西和已经计划完备，只要木坤一死，木隆一定大怒发兵，到时候木府内战已经无法阻止。就在西和得意的说出一切时，阿勒邱突然出现，木坤也起死回生。
原来阿虎在木府内就已经幡然醒悟，这一切都是阿勒邱和阿虎设下的大骗局，为的就是让西和犯错，让阿勒邱有机会来到永宁，见到木坤。
西和最后利用阿室于的生命，还是逃走了。阿勒邱要木坤带自己单独去见木隆。
在木隆面前阿勒邱把自己的身世娓娓道来，一切真相终于大白于天下，木隆知道自己被蒙骗，后悔之余又不敢回到丽江，他自己不怕死，却怕木坤也会因为自己被木增治罪。就在此时，木增单独出现，他居然一人来到永宁，面见木隆。
木隆终于被感动，绑了自己回到丽江，木坤阿雄等人被木增赦免，木隆自己一心求死，可还是被木增在祠堂饶恕，木隆终于跪倒在自己侄子面前，从此忠心不二，效忠木增。
而罗氏宁在得知一切真相后也把后宅大权完全交给了阿勒邱，一切好像完美结局， 不料五年后，西和在又一次火把节，神秘的出现，这次他的目标是木增跟阿勒邱的孩子木懿，阿勒邱为了保护木懿身受重伤，昏迷不醒，阿勒邱究竟能不能醒来，西和下场如何，所有的一切，终于走到终点........
