卫生间也就是厕所，是人们日常藏污纳垢之地，虽形式翻新，本质不变，从风水角度来看，是不宜设在主卧内的，最好设置在隐蔽静幽之处。但如果想要在主卧内设计卫生间，只要位置设计合理，也是可行的。
1、卫生间的门最好能冲着其他方向，因为卫生间在五行中主水，阴气很重，过多的进入卧室会使人身上的阴阳失衡。解决办法：可在卫生间和卧室门之间做隔断;或卫生间和卧室门之间挂珠帘;或卫生间和卧室门之间摆放绿植;或卫生间的门做成暗门。
2、厕所内一定要有抽气扇，这可把厕所内的秽气抽出街外，一方面可减轻湿臭气的祸害，另一方面亦可保持厕所内空气清新、干爽。无论于风水上来讲，还是家居生活，都更加有利于我们的健康。
3、如果主卧室有卫生间的大门直对着床，基本上是风水格局的下下签，会增加主人的精神压力。解决办法：想办法把卫生间的门改向别向；确实无法把卫生间的门改向，可在卫生间门前竖一块“隔板”、木质或塑料质或别的材料都可，隔板要高过卫生间的门。
4、传统上人们称卫生间为“茅厕”、“茅房”，上千年来，中国“唯厕是臭”的事实和厕所等于脏臭的观念根深蒂固。在古汉字里，厕所曰“溷”，其字面意思就是猪在圈里。在农村，茅厕一般都在距住宅20到100米远的猪圈里，有的还分上下两层，上层是猪圈和人方便的入口，下层是个大粪池，储藏人畜的排泄物以做农用，非常之方便，一边出恭一边还可以和猪们聊天。所以从风水的根上说，厕所是污垢之地，臭气长存，宅内不宜。
